Ma la minaccia più grave per il fenicottero è la distruzione del suo habitat: è per questo che nel corso degli ultimi anni è stata sviluppata una strategia internazionale per la sua conservazione. Tale strategia parte dalla loro conoscenza: ogni anno parecchie centinaia di giovani fenicotteri nati in Camargue e a Fuente de Pedra vengono marcati con anelli di plastica colorati. Su ogni anello sono impressi delle lettere e numeri leggibili a distanza. In tutto il bacino del Mediterraneo è possibile cosi identificare gli uccelli marcati.

Sulla base di questi studi si è così scoperto ad esempio che esistono "rotte" preferenziali e che negli ultimi anni sono aumentati gli scambi tra le popolazioni occidentali e orientali del Mediterraneo.